Σε επόμενο στάδιο η επιχείρηση μας πραγματοποιεί την επεξεργασία (εξευγενισμό) των συλλεγόμενων ποσοτήτων που προέρχονται από καταστήματα εστίασης, ξενοδοχεία, βιομηχανίες τροφίμων κλπ με σκοπό την παραγωγή της πρώτης ύλης του biodiesel.
Στη συνέχεια, το παραγόμενο προϊόν αποστέλλεται στις μονάδες παραγωγης biodiesel με τελικό αποδέκτη τα διυλιστήρια.
Το βιοντίζελ είναι ένα ανανεώσιμο και οικολογικό καύσιμο, παραγόμενο από φυτικά έλαια (ηλιέλαιο, σογιέλαιο, κραμβέλαιο κλπ), αλλά και από χρησιμοποιημένα τηγανέλαια και ζωικά λίπη.
Τα φυσικοχημικά χαρακτηριστικά του είναι όμοια με εκείνα του πετρελαίου κίνησης με αποτέλεσμα να μπορεί να χρησιμοποιηθεί σε πετρελαιοκινητήρες αναμεμειγμενο με το πετρέλαιο κίνησης σε διάφορα ποσοστά, χωρίς καμία μετατροπή αυτών των κινητήρων.
Σήμερα στην Ευρωπαϊκή Ένωση (και στην Ελλάδα) αναμειγνύεται περίπου 7% βιοντίζελ στο πετρέλαιο κίνησης. Ένα ακόμη σημαντικό χαρακτηριστικό του συγκεκριμένου βιοκαυσίμου είναι ότι οι εκπομπές ρύπων του είναι χαμηλότερες κατά 40-50% από τις αντίστοιχες του πετρελαίου κίνησης, εξαιρουμένων των εκπομπών των οξειδίων του αζώτου.